نوع مقاله : مقاله آموزشی ، پژوهشی

نویسندگان

• کریم نوبری ¹
• عبداله کاویان ²
• عباس بهاری ³

¹ استادیار بخش تحقیقات علوم دامی، مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی گلستان، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، گرگان، ایران

² مربی بخش تحقیقات علوم دامی، مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی گلستان، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، گرگان، ایران

³ استادیار پژوهشکده فناوری‌های نوین زیستی، دانشگاه زنجان، زنجان، ایران

چکیده

یکی از عناصر کلیدی تنظیم مصرف خوراک لپتین می‌باشد که با تحریک مرکز گرسنگی در هیپوتالاموس باعث تنظیم اشتها می‌گردد. علاوه بر آن ثابت شده است که این هورمون بر روی عملکرد تولید شیر برخی از گونه‌ها مانند گاو و گوسفند تاثیر می‌گذارد. هدف از این مطالعه بررسی تنوع ژنتیکی و تفاوت بین گونه‌های مختلف شتر است که نتایج آن می‌تواند ما را در شناخت بهتر این ژن و تاثیر آن بر روی عملکرد شتر کمک نماید. توالی ژن لپتین شتر ترکمن (Camelus dromedarius) به کمک توالی یابی کل ژنوم و توالی ژن لپتین شتر عربی (Camelus dromedarius)، شتر دوکانه اهلی (Camelus Bactrianus) و وحشی (Camelus Ferus) از بانک ژن (www.ncbi.nlm.gov) تهیه گردید. در این مطالعه از ژنوم یک نفر شتر ترکمن توالی‌یابی شده توسط دستگاه Hiseq 2000 شرکت ایلومینا استفاده شد. داده‌های خام حاصل از توالی‌یابی با استفاده از روش Denovo مونتاژ شد و در مجموع 235978 کانتیگ بدست آمد. سپس با استفاده از خوانش منطقه‌ای، کانتیگ مربوط به ژن لپتین استخراج گردید. سپس با تجزیه و تحلیل ژنوم هم‌ترازی بخش‌های مختلف توالی درخت فیلوژنی تهیه گردید. در کلیه موارد تجزیه و تحلیل توالی‌ها با استفاده از نرم افزار CLC Genomics Workbench 12 انجام گرفت. نتایج نشان داد که طول و توالی ژن لپتین در گونه‌های مختلف متفاوت می‌باشد. همچنین علیرغم تفاوت در توالی اگزون‌های ژن لپتین، توالی اسیدهای آمینة پروتئین گونه‌های مختلف شتر هیچ تفاوتی نداشتند. نتایج این تحقیق با تحقیقات دیگر در گونه‌های مختلف مشابهت داشت.

کلیدواژه‌ها

• شتر
• لپتین
• توالی کل ژنوم
• فیلوژنیک